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Cytoscape是一个优秀的生物软件平台，可以完成很多的生物学分析，我们可以使用cytoscape中的bingo插件，完成模式物种的GO富集分析。
首先，打开cytoscape，安装bingo插件
运行bingo
输入保存名称
输入差异基因
输入检验方式与阈值
输入要聚类的条目
选择物种
保存
运行，得到富集结果
可以看到，颜色越深，代表越显著，圆圈越大，代表富集到的基因越多
颜色表示的数值
可以将网络图导出
导出为pdf
得到表格形式的结果文件
用excel打开查看，信息包括GO号，p-value,富集的基因个数，描述，以及基因的列表，这是通过费歇尔检验得到的富集结果。
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