周围神经损伤后脊髓组织差异基因的动态表达

周围神经损伤后脊髓组织差异基因的动态表达这些mRNA主要参与细胞对脂质的反应,ATP代谢,需要能量的质子跨膜转运,核转录因子复合物,液泡质子转运V型ATP酶复合物,线粒体内膜蛋白复合物

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!

周围神经损伤可引起脊髓中mRNA的变化,寻找关键mRNA将有利于提高神经损伤的修复效果。

中国北京大学人民医院翁鉴等的一项最新研究发现,(1)实验首先建立了C57BL/6小鼠左侧坐骨神经离断模型,然后在坐骨神经离断损伤后0,1,2,4和8周获取损伤侧L4-6脊髓节段,通过RNA-seq检测其mRNA表达;(2)将坐骨神经离断1,2,4,8周的脊髓mRNA的测序结果与离断损伤0周的进行比较,并进行生物信息学分析;(3)结果显示在脊髓组织中总共有1915个差异表达的mRNAs,其中离断损伤1,4,8周后分别有4,1909,2个mRNAs发生了明显的变化;(4)测序结果提示在坐骨神经离断损伤第4周时,脊髓中差异表达的mRNAs数量最多。这些mRNA主要参与细胞对脂质的反应,ATP代谢,需要能量的质子跨膜转运,核转录因子复合物,液泡质子转运V型ATP酶复合物,线粒体内膜蛋白复合物,tau结合蛋白,NADH脱氢酶活性和离子跨膜转运活性等蛋白的翻译过程,其中一些如Sgk1,Neurturin和Gpnmb,发挥了细胞生长发育相关的功能;(5)通路分析表明,这些mRNA主要参与醛固酮调节的钠重吸收,氧化磷酸化和集合管酸分泌。基因功能评估显示,这些mRNA与炎症和细胞形态发育有关;(6)结果验证,通过脊髓RNA-seq分析,发现周围神经损伤后不同时间点涉及变化的脊髓mRNA的数量和类别不同,在离断损伤4周时涉及的mRNA数量最多,这为寻找治疗周围神经损伤的新靶点,进而研究周围神经损伤与修复的基因治疗提供理论依据。

文章研究成果发表在《中国神经再生研究(英文版)》杂志2020年7月第7期。

文章摘要:周围神经损伤可引起脊髓中mRNA的变化,寻找关键mRNA将有利于提高神经损伤的修复效果。实验旨在分析左侧坐骨神经损伤后脊髓转录组学的表达及脊髓中mRNA的变化。实验首先建立C57BL/6小鼠左侧坐骨神经离断模型,然后在坐骨神经离断损伤后0,1,2,4和8周获取损伤侧L4-6脊髓节段,通过RNA-seq检测其mRNA表达,最后将坐骨神经离断后1,2,4,8周的脊髓mRNA的测序结果与离断损伤0周的进行比较,并进行生物信息学分析。(1)结果可见在脊髓组织中总共有1915个差异表达的mRNAs,其中离断损伤后1,4,8周分别有4,1909,2个mRNAs发生了明显的变化;(2)测序结果提示在坐骨神经离断损伤后4周,脊髓中差异表达的mRNAs数量最多。这些mRNA主要参与细胞对脂质的反应,ATP代谢,需要能量的质子跨膜转运,核转录因子复合物,液泡质子转运V型ATP酶复合物,线粒体内膜蛋白复合物,tau结合蛋白,NADH脱氢酶活性和离子跨膜转运活性等蛋白的翻译过程,其中一些如Sgk1,Neurturin和Gpnmb,发挥了细胞生长发育相关的功能;(3)通路分析表明,这些mRNA主要参与醛固酮调节的钠重吸收,氧化磷酸化和集合管酸分泌;(4)基因功能评估显示,这些mRNA与炎症和细胞形态发育有关;(5)结果证明,通过脊髓RNA-seq分析,发现周围神经损伤后不同时间点涉及变化的脊髓mRNA的数量和类别不同,在离断损伤后4周涉及的mRNA数量最多,这为寻找治疗周围神经损伤的新靶点,进而研究周围神经损伤与修复的基因治疗提供了参考数据。

文章关键词:神经再生;深度测序;RNA-seq;mRNA;坐骨神经损伤;脊髓;转录组;周围神经损伤;基因治疗;表达谱

文章来源:Weng J, Li DD, Jiang BG, Yin XF (2020) Temporal changes in the spinal cord transcriptome after peripheral nerve injury. Neural Regen Res 15(7):1360-1367.

免责声明:本站所有文章内容,图片,视频等均是来源于用户投稿和互联网及文摘转载整编而成,不代表本站观点,不承担相关法律责任。其著作权各归其原作者或其出版社所有。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,侵犯到您的权益,请在线联系站长,一经查实,本站将立刻删除。 本文来自网络,若有侵权,请联系删除,如若转载,请注明出处:https://itzsg.com/73845.html

(0)

相关推荐

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注

联系我们YX

mu99908888

在线咨询: 微信交谈

邮件:itzsgw@126.com

工作时间:时刻准备着!

关注微信