基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟Sophia 关键词 CP2K 烷烃 裂解 高温 分子模拟在有氧气的情况下 物质在高温下发生的分解称为燃烧 而在没有氧气的情况下则称为热解 烷烃的质量越大 支链越多 热解的速率通常也会越大 烷烃的裂解涉及到 C C 和 C H 键的断裂 是自由基机理

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Sophia

关键词:CP2K;烷烃;裂解;高温;分子模拟

在有氧气的情况下,物质在高温下发生的分解称为燃烧,而在没有氧气的情况下则称为热解。烷烃的质量越大,支链越多,热解的速率通常也会越大。烷烃的裂解涉及到C-C和C-H键的断裂,是自由基机理。本案例将通过CP2K软件实现烷烃的热解反应。

初始模型的构建

首先通过packmol软件将10个正葵烷插入到3*3*3 nm3的立方盒子中,输入文件如图1所示:

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟



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图1 packmol 输入文件

所构建的初始模型如图2所示:

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

图2 十条正葵烷分子链初始模型

在CP2K的输入文件中任务类型选择MD,理论方法采用GFN1-xTB,采用NVT系综,热浴采用CSVR,温度设为3500K(温度设置较高加快反应的进行),热浴TIMECON设为100,步数STEPS设为50000,步长TIMESTEP设为0.2,部分输入文件如图3所示:

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

图3 CP2K部分输入文件

可以看到,随着模拟的进行,经过10 ps后,正葵烷被裂解为大量的小分子碎片。如图4所示,体系中不存在完整的正葵烷分子链。

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

图4 模拟过程中正葵烷分子链的裂解情况

我们进一步考察体系中具有不同成键数的碳原子的数目变化(图5),可以看到,有100个C原子的成键数都是4,因为体系一开始所有的C原子都来自正葵烷,都属于sp3碳,10条正葵烷分子链总共是100个碳原子。随着模拟的进行,长链烃开始裂解,开始出现短链烃烷,烯烃和炔烃,因此C(4)逐渐减少,C(3),C(2)逐渐增多。C(1)和C(0)主要来自于一些不稳定的分子碎片。从图6也可以看出,C-C键和C-H键在数目在反应过程中也在逐渐减少。

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

图5 模拟过程中具有不同成键数的碳原子的数目变化

基于CP2K的高温下烷烃裂解分子动力学模拟

图6 模拟过程中C-C和C-H键数目的变化

结语
本案例通CP2K成功实现了正葵烷分子链的热裂解反应,对于相关领域的研究人员和工程师来说,本案例提供了一个有力的工具,可以为解决实际问题提供理论依据和技术支持。

最后,如果您对于该案例感兴趣,欢迎通过公众号“320科技工作室”与我们联络,获取完整的案例支持与个性化定制解决方案!

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