基因富集分析（GO、KEGG）图一键生成神器——Metascape

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!

背景介绍

最近在分析一些组学数据，所以就把相关的内容都在翻着看！那么我们推文的核心还是以绘图为主，所以就来一篇关于基因富集分析（GO、KEGG）图的制作。

Metascape是一个为基因提供功能注释的网站工具，网站不仅更新及时，而且操作简单，分析较快，对于组学研究来说确实是一个不可多得的实用工具。

软件介绍

[软件名称]：Metascape

[软件网址]：https://metascape.org/

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使用教程

1.打开网站，可以在方框中输入数据，也可以直接select file输入数据，旁边有例子，也可以用例子自己先摸索一下

默认分析

2.这里我输入几个我自己实验的基因（RNA-seq的差异基因，你也可以是网络药理获得的基因），选择输入的物种（我这里是大鼠Rattus norvegicus），然后点击Express Analysis

3.软件分析中

4.点击分析报告

5.然后这里就可以看到所有富集出来的信息，在最上方，点击就可以下载对应的文件（Excel文件，PPT文件），下方的则为网页版报告

6.里面就包含了GO和KEGG富集结果

7.下载文件包括以下几种格式

8.还有对应的蛋白互作网络

9.下载下来的PPT文件也是非常精美，结果完美呈现，直接使用在文章中即可（记得添加参考文献）。

10.表格包括注释

11.以及相应的功能富集，也可以自己用来作图

选择性分析

12.当然，你也可以选择自己仅需要的分析，那么点击Custom Analyasis

13.点击富集，选择GO的三个MF，BP，CC，以及KEGG通路分析，上面的参数自己可以根据实际情况调节一下，然后选择富集分析

14.然后就分析完成了

15.点击查看富集结果

16.然后就跟上述一样，查看对应的结果即可

17.赶紧来试试吧！