perl联系——计算点突变

perl联系——计算点突变一 程序目的 计算序列点突变 Point Mutations 输入 GAGCCTACTAAC CATCGTAATGAC 输出 7 二 程序设计读取序列后利用 split 分割字串 然后注意比较 注意 perl 字符比较用 ne

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!

一、程序目的:计算序列点突变(Point Mutations)

输入:

GAGCCTACTAACGGGAT CATCGTAATGACGGCCT 

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!

输出:

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!7 

二、程序设计

读取序列后利用split分割字串,然后注意比较,注意perl字符比较用“ne”(不等于)。

#!/usr/bin/perl/ use strict; my (@seq, @seq1, @seq2, $distance); @seq = <>; # @seq1 = split //, chomp($seq[0]); # 这样会出错,chomp有返回值0 1 # @seq2 = split //, chomp($seq[1]); @seq1 = split //, $seq[0]; @seq2 = split //, $seq[1]; for(my $i = 0; $i <= $#seq1; $i++){ if($seq1[$i] ne $seq2[$i]){ $distance++; } } print $distance."\n";

三、补充

perl比较

数字 字符
大于 > lt
小于 < gt
等于 == eq
不等于 != ne
大于或等于 >= ge
小于或等于 <= le

其他的代码:

欢迎大家来到IT世界,在知识的湖畔探索吧!#!/usr/bin/perl # my @str = <STDIN>; my $c = 0; for ($i = 0; $i < length($str[0]); $i++){ $c++ if (substr ($str[0], $i, 1)) ne (substr ($str[1], $i, 1)); } print "$c\n";

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